在堆肥的过程当中，微生物的活动是核心要素。不同种类的微生物在分解有机物时，分类可分为好氧微生物和厌氧微生物。好氧微生物在有氧环境中更为活跃，它们以有机物为食，进行代谢。这个过程中，众多生物酶的出现会加速有机物的分解，并大量释放热量，导致堆体温度的迅速上升。

微生物的生长与代谢是温度升高的主要驱动因素。例如，细菌和真菌在堆肥中占主导地位，它们会在有氧条件下将复杂的有机物质分解成简单的分子，如氨基酸和核苷酸，这个过程产生的能量大部分以热的形式释放出来。

 2. 有机物的化学组成

不同类型的有机废弃物化学组成的不同也直接影响到发酵过程中温度的变化。例如，碳、氮比（C/N比）在堆肥发酵中起着重要作用。高C/N比的材料（如干草和树叶）在发酵初期分解缓慢，较低的温度维持相对稳定。但一旦添加一些高氮材料（如菜叶和动物粪便），微生物的活性会显著提升，导致温度迅速升高。

 3. 堆积方式

堆肥的堆积方式也会影响微生物的活性，进而影响温度生成。堆肥的高度、密度、体积和通气性等因素都会影响空气的流通，进而影响氧气的供应和微生物的活动。较为紧凑的堆肥堆，因为通气性差，可能会导致某些厌氧微生物的活跃，而这些厌氧过程通常不如好氧过程那么高效。

在构建堆肥堆时，合理的堆积方式、设置适当的通气口是确保氧气充足、提高发酵效率的重要条件。

 4. 外部环境因素

外部环境亦直接对堆肥的温度产生影响。特别是在夏季，阳光的照射和外部空气的温暖会加速堆肥内部温度的上升。如果环境湿度恰当，有利于微生物的繁殖，堆肥的温度可能会超过60℃，进入高温期。反之，在秋冬季节，温度偏低则可能导致堆肥温度的升高缓慢。